CSPACE-4057: Fixed another authRefs test to reflect change of fields to date datatype.

CSPACE-4057: Fixed various authRefs tests to reflect change of fields to date datatype.

CSPACE-4030 - preclude gratuitous NPE errors when processing payloads with extra parts (e.g., after updating Person with links to other persons).

NOJIRA - Removed gratuitous override that replicated work in superclass.

CSPACE-1927 Update to displayName for an authority item will update all the references to that item. Loops through found referring objects in sets of 100, updates the fields that match, and saves en bulk (does not invoke normal validation, etc.). Fixed some minor bugs in Person Validation handlers that would produce gratuitous errors.

CSPACE-3268: Fixed errors related to loanStatusGroupList and its child elements in services Loan Out schema and tests.

NOJIRA - Added better comments for fidDocs API. No functional changes.

NOJIRA - restructured deploy target very slightly to have a separate target to deploy the tenant config. Useful in development.

NOJIRA - added note on cross-platform vulnerability for a debug utility. No functional changes.

NOJIRA - tweaked log output (no functional changes).

CSPACE-4057,CSPACE-3268,CSPACE-3269: Set datatype of multiple date fields, across various object, procedural and authority records, to a date type (xs:date) in services XSD schema. Revised tests accordingly. Added loanInAuthorizationDate and repeatable loanStatus group to Loan In Schema. Added borrowersAuthorizer and borrowersAuthorizationDate fields to Loan Out Schema, also renamed loanedObjectStatus repeatable group and its fields to name/prefix loanStatus.

CSPACE-3686: Comparisons of 'before and after' values of BigDecimal fields, which result from xs:decimal datatypes in services XSDs, should be done via BigDecimal's compareTo() method, which is scale-agnostic. Change made in CollectionObjectServiceTest to reflect this; we can use this type of comparison elsewhere in services client tests, as well.

CSPACE-3686: Explicitly set scale for comparision of two BigDecimal values in CollectionObjectServiceTest.read().

CSPACE-3686: In Cataloging / CollectionObject, Media and Blob services, Dimensions are now a subordinate, repeatable sub-group within groups of Measured Parts.

CSPACE-1927 - Adding tests to check the displayName update.

CSPACE-4568: Removed 'largetext' references to two fields that have been converted from string to numeric datatypes, collectionobjects_common:age and collectionobjects_common:ownershipExchangePriceValue, from Nuxeo database template config files for MySQL and PostgreSQL.

CSPACE-3627: Committing Rick's patches to make a Title Translation sub-group within the Title group in the common schema for Cataloging / CollectionObject records.

CSPACE-4567: Fixed parent POM artifact ID and project name in Authority service POM.

CSPACE-4533,CSPACE-3231: Changed the way that empty strings are handled in services request payloads. Now, for non-date values, these result in null values being passed to Nuxeo, rather than empty string values.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated the list of fields, in all remaining sections of Cataloging / CollectionObject records, that hold authority references and terms from controlled lists.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated the list of fields, in the Object Production Information and Object History and Association Information sections of Cataloging / CollectionObject records, that hold authority references and terms from controlled lists.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated the list of fields, in the Object Description Information section of Cataloging / CollectionObject records, that hold authority references and terms from controlled lists.

CSPACE-4478,CSPACE-4479,CSPACE-4538: Uniformly added measuredBy, measuredPart, and measurementMethod fields to dimensions repeatable groups in the services, in CollectionObject / Cataloging records and Dimensions records, matching both the dimensions repeatable group already present in Media records and the wiki Dimensions schema.  This schema change simply adds fields to an existing repeatable group, matching the wiki wireframe and the current UI layout, and doesn't attempt to address any requirements for sub-repeatability as per CSPACE-3686.

CSPACE-4406 - added support for refObjs for vocabulary service items, so that termList items can check for usage. Uses new termRef configuration, so that authorityRefs paylaods do not include termList items in the results.

CSPACE-4457: Fixed parent element name for 'type' multivalued field in Media-related termRef in tenant bindings prototype.

CSPACE-3159 - changed getDomainId() to only dump stack trace when trace enabled. On initial startup, we were always dumping the stack when we created domains. The method still returns null, and the callers handle it appropriately.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for Object Identification Information group within Cataloging records, in prototype tenant bindings.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for Location (Storage Location) and Taxon records, in prototype tenant bindings.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for Organization records, in prototype tenant bindings.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for Person records, in prototype tenant bindings. Added missing namespace declarations to commented-out termRefs.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for Contact records, in prototype tenant bindings.

CSPACE-4481 Missing call in RelationDocumentModelHandler.handleUpdate() to do the work that .handleCreate was doing to populate the doctype, uri, etc. Fixing this surfaced more test case bugs (i.e., assuming that relation fields were string buckets without semantics).

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for Acquisition records, in prototype tenant bindings.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Fixed typos in tenant bindings proto.

CSPACE-3178 Modified authorityItem create and update to accept refNames in place of csids for children and parent identifiers in relations. Extensive cleanup related to relations, and to refName handling. Fixed bugs in handling of relations payloads. Many tests cleaned up to properly handle refNames. Lots of cleanup related to build dependencies among authority packages. Restructured authority project to properly separate jaxb and services classes (to resolve dependency cycles).

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for Group records, in prototype tenant bindings.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for Intake records, in prototype tenant bindings.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for Loan In records, in prototype tenant bindings.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for Loan Out records, in prototype tenant bindings. Also, a correction to the previous commit comment on these issues: r5708 committed similar changes for Media records, not for Movement records.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for movement records, in prototype tenant bindings.

CSPACE-3178: Quick hack to disable use of garbage refNames in taxonomy authority (taxon) client tests, since refNames are now generated by the services.

CSPACE-3178: Modification of quick hack to disable garbage refnames in location authority client tests.

CSPACE-3178: Quick hack to disable use of garbage refNames in location authority client tests, since refNames are now generated by the services.

CSPACE-4457,CSPACE-4472: Reviewed and updated authRefs and termRefs for object exit and movement records, in services prototype tenant bindings.

CSPACE-4468,CSPACE-4470: Added constants for subject and object doctype fields in relation records.

CSPACE-4468: Placeholder code en route to making refNames first class identifiers in Relation records.

CSPACE-4470 Refactor the resourceMap to use the service name rather than the fully qualified classname. Cleaner, and makes the map usable in converting refName to CSID.

CSPACE-4468: Trivial change to use of Tools.isBlank() in Relation validator.

CSPACE-4468: Validation for creation of new Relation records now accepts either CSIDs or refNames as identifiers for the subject and object of the relation.

CSPACE-1927 - Refactoring and adding detection of displayName and refName changes, in preparation for final fix.

CSPACE-4468,CSPACE-4470: Updating Relation JAXB schema to match the corresponding Nuxeo schema.

CSPACE-4464: Ignore <uri> values in update payloads for Contacts records.  The services now generate the value of that field, which usually will include contextual information for the owning authority and authority item.

CSPACE-4468,CSPACE-4470: Added constants for new style fields in Relation records.

CSPACE-4468: Added stub handleCreate and handleUpdate methods to Relation doc model handler.

CSPACE-4468,CSPACE-4470: Added subjectRefName and objectRefName fields to Relation record schema in support of making refNames alternate identifiers for Relation records, alongside CSIDs. Added subjectDocumentType and objectDocumentType fields to Relation record schema to continue transitioning to new style field names, from ambiguous old style names like 'documentType1' and 'documentType2'.

CSPACE-4464: The 'uri' values in lists of Contact records now reflect the context in which the list was requested; e.g. /personauthorities/{csid}/items/{csid}/contacts/{csid}, /orgauthorities/{csid}/items/{csid}/contacts/{csid}, or simply /contacts/{csid}.

CSPACE-1927 - Refactored how displayName computation is done in prep for handling them better on update.

CSPACE-4448 - Made default listing of vocabularies in an authority sort by displayName, rather than updatedAt.

CSPACE-3442: Added /roles/{csid}/accountroles/ resource to the "authorization" service.  Use this method to get a list of accounts that are associated to a specified role.

CSPACE-4199,CSPACE-4232: Acquisition service modified to take advantage of parameterization of static Nuxeo doc type files.

CSPACE-4199,CSPACE-4232: Movement service modified to take advantage of parameterization of static Nuxeo doc type files.

CSPACE-4199,CSPACE-4232: Loanout service modified to take advantage of parameterization of static Nuxeo doc type files.

CSPACE-4199,CSPACE-4232: Loanin service modified to take advantage of parameterization of static Nuxeo doc type files.

CSPACE-4199: Media service modified to take advantage of parameterization of static Nuxeo doc type files.

CSPACE-4199: Intake service modified to take advantage of Richard's parameterization of static Nuxeo doc type files.

CSPACE-3178: Added convenience methods to Authority, AuthorityItem in common-api to get short identifier and (for items) parent short identifier.

CSPACE-3178,CSPACE-2215: Payloads to create authority or voculabulary resources now no longer require short identifiers. Short identifiers will be generated from display names, consistent with handling of vocabulary or authority item payloads. Created utility method to isolate logic around identifier generation, to facilitate future work on CSPACE-2215.

CSPACE-3178: Vocabulary service and various authority services now accept null or blank short identifiers in create payloads, when creating items (terms) in a vocabulary or authority, because (per other recent work on this issue) short identifiers are now generated if not supplied. When creating vocabularies (as opposed to terms within a vocabulary), short identifiers are still required, per Patrick. Short identifiers provided in update payloads are now ignored.

CSPACE-3911: Workaround to make it possible to ingest legal XML documents containing XML entities (e.g. '&amp;', '&lt;', '&quot;') into the Imports service, by 'double-encoding' ampersands at the start of those entities.  This is intended to preserve those entities past an initial parse, that takes place during a pre-processor stage of the import process.

CSPACE-3178: Minor fix to lowercasing service name.

CSPACE-3178,CSPACE-2215: First iteration of automatic creation of refNames from short identifiers, and of short identifiers from display names, in authority and vocabulary services. Currently, client-supplied refNames are still accepted, rather than being dropped; this will change soon.

CSPACE-3270,CSPACE-1018: Displayname in Contact records is now updated when record updates are performed.

CSPACE-3270,CSPACE-1018: Contact records and list items now include generated displayname.

CSPACE-3759: Updating Nuxeo client libs, bundles, and configurations for eventual upgrade to Nuxeo 5.4.x

CSPACE-3759: Updating Nuxeo client libs, bundles, and configurations for eventual upgrade to Nuxeo 5.4.x

CSPACE-3759: Updating Nuxeo client libs, bundles, and configurations for eventual upgrade to Nuxeo 5.4.x

CSPACE-3759: Updating Nuxeo client libs, bundles, and configurations for eventual upgrade to Nuxeo 5.4.x

CSPACE-3270,CSPACE-4172,CSPACE-3332,CSPACE-1018: Updated Contact schema to reflect current wiki schema. Updated Contact service to use AbstractCommonList and DocHandlerBase. Includes stub code to generate a displayname from constituent fields.

CSPACE-4233: Updated security service client tests to fix broken test cases due to change of dimension value field from string to decimal datatype.

CSPACE-4233: Updated workflow service client test to fix broken test due to change of dimension value field from string to decimal datatype.

CSPACE-4233: Converted services fields in CollectionObject / Cataloging, Acquisition, Dimension and Media records to integer or decimal datatypes, as appropriate. Also converted apparently internal field in Blob record to decimal datatype, to match its counterpart in Media.

CSPACE-4365: Switched to xs:decimal from xs:float in XSD datatype declarations for objectPurchasePriceValue field in Acquisitions records, in the services. While a more appropriate XML Schema datatype, this did not result in any changes in the database (even after dropping and re-creating the database): this field was still defined as datatype 'double precision' in PostgreSQL.

CSPACE-4376: Updated version number in services POMs and build.properties to 1.12-SNAPSHOT, from 1.11-SNAPSHOT. Starting after removing local Maven repository, services build/deployment succeeds and all tests pass.

CSPACE-4345: Cleaned up vestigial 'import' modules in four vocabulary and authority services: vocabulary, person, organization and location. The presence of these long-unused modules, following conversion of each of those services to emit list results in AbstractCommonList format, was resulting in compilation errors while attempting to generate the distribution tarballs via 'ant dist-jboss-domains', as these old import modules were referenced by the dependent 'dist' task.

CSPACE-4356 Made AuthorityItem searches and lists default to sorting by displayName, instead of the global default (updatedAt).

CSPACE-4335: XMLReplay test of advanced search within a single field in an extension schema is now working, after updating HTTP BasicAuth credentials for the lifesci admin user.  The relevant test groups in the advanced search control file have been added to the XMLReplay master file in IntegrationTests, so we'll have regression testing of advanced search in both the common and naturalhistory schemas for CollectionObject.

CSPACE-4335: Corrected value mismatch between create payload and expected response payload in CollectionObject advanced search test.

CSPACE-4335: Added XMLReplay run file for CollectionObjects advanced search, omitted from previous check-in. Renamed several test data files for clarity. Added GET test to test group that checks advanced search against a field in an extension schema.

CSPACE-4335: Added XMLReplay-based tests to the services IntegrationTests module to test advanced search in CollectionObject / Cataloging records. Testing of advanced search in a field in an extension schema has not yet been successful, and that test is not currently active.

CSPACE-4330: Changed datatypes for numberOfObjects in CollectionObject records to xs:integer (which converts field to bigint type in PostgreSQL) and for objectPurchasePriceValue in Acquisition records to xs:float (double precision in PostgreSQL). Services tests pass, but it would be desirable to add tests for these fields. We may also want to consider xs:decimal type for currency types.

CSPACE-4348: Modified AuthorityResource to use same "search" (keyword and advanced) method as all the other services.

CSPACE-2844 - Added flags and logic to preclude changes to the prebuilt Accounts and Roles. Added tests for same. Fixed some subtle bugs in the semi-related document handlers for Permission, Role, and Account.

NOJIRA - Added safety check in filterReadOnlyPropertiesForPart to ensure it only checks for values in the common part. Quite an edge case, but would be a very confusing bug if someone created an extension part that had fields with the same names and tried to update them.

NOJIRA - Slight refactoring of password validation, and improved error message for invalid passwords. This does NOT represent a functional change, but rather just cleanup. Also added comments to the payloads for account testing to explain the base64binary encoding of password values in payloads. Again, no functional changes.

CSPACE-4328 Added additional support to enforce read-only semantics of most core part properties. Added a test to Intake to verify this functionality.

CSPACE-4328 Added support for createdBy and updatedBy to the collectionspace_core schema. These fields are now set and maintained by all of the nuxeo repository services (i.e., they are not maintained for AuthN and AuthZ services: user, account, role, perms, etc.). The values are the userId of the currently authenticated user. This changes requires a complete (create_db) rebuild of a repository.

CSPACE-4262: Added code to read env variables for Nuxeo username and password that will override those values in the config file at jboss-4.2.3.GA\server\cspace\cspace\config\services\service-config.xml

NOJIRA: Fixing broken Ant deploy path for the 3rdparty/Nuxeo core document type for the CollectionObject service.

NOJIRA: Restoring postgres settings to be the default database server -had accidentally checked-in MySQL settings.

CSPACE-4232: Consolidating Nuxeo document type "boiler plate" settings/config files into top-level 3rdparty directory.