Merge remote-tracking branch 'upstream/master' into cspace-5271

Conflicts:
services/authority/service/src/main/java/org/collectionspace/services/common/vocabulary/AuthorityResource.java

Merge branch 'CSPACE-5300'

CSPACE-5300 - Fix problem with CMIS calls. Document type must have schemas declared.

Merge branch 'master' of github.com:collectionspace/services

CSPACE-5300: Modified the Group and ObjectExit nuxeo document types to inherit from the CollectionSpaceDocument type.

Just a test

Merge branch 'CSPACE-5300'

CSPACE-5300 Added support to servicegroup service for CMIS queries. Does not properly sort on updatedAt, due to Nuxeo bug (filed).

Merge branch 'CSPACE-4789-A'

Merge branch 'CSPACE-4789'

CSPACE-4789: Added support for a query param impTimout that specifies a timeout period in seconds -the default is 600

CSPACE-4789: Call to start a new Nuxeo transaction now takes an optional timeout period paramter.

CSPACE-5129: Cleaned up repository session managment and transaction management when making resource to resource method calls.  The ServiceContext is now able to keep track of RepositorySession instances and keeps reference counts on them.  Only when the reference count drops to 0 is it released and the transaction closed.

Merge branch 'master' into CSPACE-5129

CSPACE-5036: Since we can't seem to get paging on CMIS queries working, we need to update the paging info in the list results to show meaning statistics.

CSPACE-5036: Added ORDER BY support to CMIS queries.

NOJIRA: Maven pom.xml cleanup changes.

Allowing timeout period to be a query param of the import request.

CSPACE-3771, CSPACE-4791 refObjs call did not support wf_deleted filter, so was not correctly ignoring soft-deleted records. Since term delete checks for refObjs, this caused failure on term delete for which referencing objects had been (soft) deleted.

CSPACE-5271: Removing unused class variable.

Merge remote-tracking branch 'upstream/master' into cspace-5271

CSPACE-5271: Clean up cruft, tweak comments.

CSPACE-5271: List of docType keys for the UriTemplateRegistry now comes from tenant bindings configuration (albeit for an arbitrary tenant). All docTypes appear to be populated successfully. There is currently only one entry for the Contact doctype - whichever is last populated in the registry - although there can be multiple authority item types that count Contacts as a sub-resource.

CSPACE-4989, CSPACE-4115 Simplified queries that compute the referencing objects given a refName. Will improve performance, and make the system more stable. Enabled checking Cataloging records, for Used-By computations.

CSPACE-5271: Added debugging to dump UriTemplateRegistry contents.

CSPACE-5271: Remove per-resource cacheing of UriTemplateMap; likely would not have worked as designed. Make generic method for getting a UriTemplate by type in ResourceBase and sub-classes.

CSPACE-5271: More work on returning UriTemplates from resource classes, for inclusion in the registry.

CSPACE-5271: Store type in UriTemplates. Establish initial pattern for returning multiple registry entries from resource base classes. Lots of miscellaneous cleanup.

CSPACE-5271: Added comments to ResourceBase.

CSPACE-5217: Initial placeholder population of uriTemplateRegistry, *not* yet tested.

CSPACE-5271: Revised factory methods to emit URITemplates with and without stored values.

CSPACE-5271: Factory now emits only StoredValueUriTemplate objects; UriTemplate objects are now abstract.

CSPACE-5271: Added additional error checking when manipulating maps of values for constructing URI strings.

CSPACE-5271: Added UriTemplate subclass in which static values, like path components, can be stored. Created skeletal UriTemplateRegistry.

CSPACE-5271: Added negative tests; began logging non-fatal exceptions.

CSPACE-5271: Added second test case for generating a URI string via variable expansion, using a provided Map.

CSPACE-5271: Renamed UriTemplateBuilder to UriTemplateFactory; added initial unit test for UriTemplate.

CSPACE-5271: Added initial draft of UriTemplate class. Renamed UriBuilder to UriTemplateBuilder, to better describe its purpose and to avoid potential conflict with same-named RESTEasy class.

CSPACE-5271: Initial placeholder draft of UriBuilder class.

CSPACE-5295: Update Jasper Reports JAR to version 4.5.1, from 4.0.1.

NOJIRA: Fixed trivial typo in constant for query parameter used in report invocation.

CSPACE-5301,CSPACE-5073: Added refName parsing test for item display name containing a single apostrophe (') character. Added log4j properties file to suppress non-fatal exception when running common-api tests. Tests now output to console using logger, like other tests.

CSPACE-5301,CSPACE-5073: Minor changes to comments in refName test class.

CSPACE-5301,CSPACE-5073: Added two unit test cases for refNamedisplay names containing colons and parens, both separator characters used elsewhere in refNames.

Merge pull request #33 from aronr/cspace-5301

CSPACE-5301: refName parsing for authorities and authority items now uses tokenization code exclusively, rather than tokenization code in some code path(s) and regex code in other(s). The tokenization code, among its many virtues, handles parens in the displayName parts of refNames with aplomb. After making this change, all services tests (including refName-specific parsing tests in the common-api module) pass. As well, it is now possible to save authority item records with the addition of a broader or narrower term, whose displayname contains parens.

CSPACE-5301: refName parsing for authorities (as contrasted with authority items) now also uses tokenization code exclusively, rather then tokenization code in some code path(s) and regex code in other(s).

CSPACE-5301: refName parsing for authority items now uses tokenization code exclusively, rather then tokenization code in some code path(s) and regex code in other(s).

Merge pull request #31 from jessemartinez/CSPACE-5292

CSPACE-5292: Updating Jasper iReports files, which generate a sample report for a single Acquisitions record, to remove the unused and incorrect accessiondate field that was recently converted into a structured date field. Verified that the current report is broken, and that Jesse's replacement files generate a correct report for all included fields.

CSPACE-5073 Limited tokens split on separator for refNames, allowing separator to be used in displayNames.

CSPACE-5241: Import records now accept additional attributes on the <import> tag: createdAt, createdBy, updatedAt, and updatedBy. These allow some implementer-requested metadata from legacy systems to be imported.

CSPACE-5294,CSPACE-4579,CSPACE-5241: Minor tweak to FileTools method, to revert to defaulting to system encoding, as suggested by Richard. Traced and documented behavior of a key macro variable expansion method in Imports service, in part to verify CSPACE-4579 functionality and in preparation for work on CSPACE-5241.

Update .gitignore

Update .gitignore

NOJIRA: fixing .gitignore

NOJIRA: removing edits to .gitignore and removing cached version of same file

CSPACE-5292: updating Jasper iReports files to remove unused and incorrect accessiondate field that was recently converted into a structured date field. This new field type was breaking the Jasper template. Since that field, even when formatted correctly, wasn't used it was safe to remove entirely from the template. I also modified the report template in minor ways to fix field widths.

Merge branch 'master' of git://github.com/collectionspace/services

Merge remote-tracking branch 'upstream/master'

CSPACE-5293: Make common-api FileTools.saveFile() method always use UTF-8 encoding.  This method is invoked by the Imports service to create intermediate files; on some platforms / environments, these files were being written using a non-UTF-8 encoding.

Merge remote-tracking branch 'remotes/origin/master'

Merge branch 'master' of git://github.com/collectionspace/services

CSPACE-5012: Remove some System.out messages added while debugging.

CSPACE-5012: Now correctly retrieves values from both namespaced and non-namespaced elements, as well as from records that have multiple schema parts (such as a common and extension part). Uses an abominable hack to wrap the XML fragment before extracting inAuthority value.

CSPACE-5012: Change inAuthority xpath to ignore namespace, and correct some doctypes.

CSPACE-5012: Tenant unqualify the docType prior to using it to construct the collectionspace_core:uri value; previous commit to TemplateExpander didn't do this.

Merge branch 'CSPACE-5289'

Merge remote-tracking branch 'remotes/origin/master' into CSPACE-5289

CSPACE-5289 Added default ORDER BY clause when finding docs with mix of doc types.

Merge branch 'CSPACE-5289'

CSPACE-5289 Fix declaration of objectNumberProperty for Media

Merge pull request #30 from aronr/cspace-5012-addtl

CSPACE-5012: Remove redundant code block following Ray's change to always remove tenant qualification from doctype names, when constructing the collectionspace_core:uri values for imported records.

CSPACE-5012: Remove redundant code block following Ray's change to always remove tenant qualification from doctype names, when constructing the collectionspace_core:uri values for imported records.

Merge branch 'master' of git://github.com/collectionspace/services

Merge pull request #29 from ray-lee/f79fb3ea94d9fc90a232cbaa8cde36a136e449a9

CSPACE-5012: Fix for importing into tenants with extended doctypes

CSPACE-5012: Use unqualified doctype in call to getServiceBindingForDocType.

Merge pull request #27 from aronr/cspace-5229

CSPACE-5229: Remove case-sensitivity when adding matching non-preferred ...

CSPACE-5229: Remove case-sensitivity when adding matching non-preferred terms to partial term search results.

CSPACE-5036: Needed to shuffle some of the Relationship service constants to avoid dependency cycles.

CSPACE-5036: Adding new interface for relationship service to avoid dependency cycle.

Merge branch 'master' into CSPACE-5036

CSPACE-5036: Just a debug output code formatting change.

CSPACE-5036: Added support for the "rtEither" and "rtObj" query params.  Now you can search by subject, object, or both.

CSPACE-5012: Correct name of parent authority services for taxonomy records.

CSPACE-5012: Trivial clarifying change to method name.

Merge pull request #26 from aronr/cspace-5012

CSPACE-5012: Populate the 'uri' value in collectionspace_core when importing records via the Imports service. (Note: does not yet work for Contacts or any other sub-resources.)

CSPACE-5012: Renamed variables for greater clarity.

CSPACE-5012: More minor cleanup.

CSPACE-5012: More trivial comment cleanup.

CSPACE-5012: Remove old comment.

CSPACE-5012: When populating collectionspace_core:uri with URIs for authority item records, handle extensions to the authorities doctypes by getting their base (unqualified) doctypes.

CSPACE-5036: Final support for CMIS query to list all items/resources in a relationship with specified subject_csid.  Uses 'rtSbj' query param on service list requests.  For example, http://localhost:8180/cspace-services/collectionobjects?rtSbj=8d1ab4a3-9319-4793-beda returns a list of collection objects related to the document with csid=8d1ab4a3-9319-4793-beda as the subject.

CSPACE-5012: Renamed method for generality; refined and added FIXME comments.

CSPACE-5012: Made XPath expression evaluator a class variable; added multiple FIXME comments.

CSPACE-5012: Now appears to correctly add parent authority service and parent vocabulary CSID to collectionspace_core:uri for authority services.

CSPACE-5012: Simplified generation of collectionspace_core:uri values, based very loosely on a discussion of future registry directions with Patrick. inAuthority value in authority item uri values is currently stubbed.

Merge branch 'master' of github.com:jessemartinez/services

Merge branch 'master' of git://github.com/collectionspace/services

Merge branch 'master' into CSPACE-5036

NOJIRA: Updating build.properties release version to 2.5, from 2.2. Relates to Richard's commit e96b3d77ce5b84ccb7a0e535cb940f10c64d0ffd to update services POMs in master to release 2.5.

Merge branch 'master' of github.com:jessemartinez/services