DRYD-186: Changing GET query param for a role from includePerms to showPerms

DRYD-186: Added support for PUT requests on Roles that contain associated permissions.  A role's existing permissions list will be replaced with the ones sent in the PUT request.

DRYD-186: POSTs to the Role resource can now declare a set of permissions to associate with the new role.  If the permissions don't exist, the Services will create them.  The permissions MUST include values for the actionGroup and resource.

Merge branch 'master' of github.com:collectionspace/services

DRYD-186: permissionId values in permroles payload is now optional.  Service layer can find Permission records using the resourceName/actionGroup tuple.  Services layer will create new Permission records if the permroles payload refers to non-existent Permission records.  This will allow clients to create new roles (and update existing roles) with permissions in one request.

DRYD-169: Move password reset URLs into spring security filter chain, with anonymous access.

DRYD-169: Support for new password reset mechanism.  Password reset is now negotiated between only the UI and Services layer -App layer (except for config settings) is left out of the process.

DRYD-126: Added support for 'mkRtSbjOrObj' query param on calls to /servicegroups/*/items.

Update pom.xml

DRYD-122: Made 'rel' the namespace prefix for the relations-common-list type.

DRYD-177: Reduce logging output to catalina.out of authority/vocab term creation.

DRYD-177: Changed auth/vocab reset to be 'false'.

DRYD-177: Now saving the state of a tenant's authority/vocab initialization.  If already initialized, the Service layer will skip authority/vocab init at startup.

DRYD-177: Fixed crashing issue with authority definitions with no initial terms defined.

DRYD-177: Supports definition of authorities/vocabularies and terms in the service bindings.

DRYD-177: First stages of moving authority and vocab initialization to the Services startup.

NOJIRA: Added additional logging and error reporting to Import service.

NOJIRA: Reduced default output of Import service.  Added support for impTimeout and impTimout query params.  Fixed error handling of Import service POST requests.

NOJIRA: Testing Nuxeo Importer service to see if we can replace our custom importer code with theirs.

Merge branch 'master' of github.com:collectionspace/services

CSPACE-6846: Fixed issue where docID variable was not properly expanded in import payloads.

Update authority-request.xml

Update authority-request.xml

Fixing malformed refnames.

DRYD-127: Add an API to delete relations given a subject, object, and/or predicate

DRYD-176: Added checks to DELETE and UPDATE requests to prevent changes to locked resources/records.

DRYD-121: Adding 'mkRtSbjOrObj' query param so you can get a list of marked related items -either as subject or object.

DRYD-120: Added support for 'sbjOrObj' query param so you can find relationships where the the CSID is either the subject or the object.

DRYD-131: Now supports one or more predicate query params.

DRYD-119: Added support for rtEither query param to find relationships that with either the subject or object csid.

CSPACE-6967: Corrected a problem where base authority class was accidentally deleting authorities.

NOJIRA: Merged master branch with v4.5-branch.

CSPACE-7124: Added workaround to Nuxeo bug that prevented the clearing of structured date fields in some records.

CSPACE-7125: Changed pom to get gbif jars from CollectionSpace maven repo.

NOJIRA: Updating Maven version tags to 5.0-SNAPSHOT

NOJIRA: Creating release branch for v4.5 for CollectionSpace

CSPACE-7100: Change structured date parser to prefer month-day-year instead of year-month-day.

CSPACE-6901: Removed hard-coded domain string from CE and BCE refnames.  Added code to inject current tenant domain string into the BCE and CE refnames.

Merge branch 'master' of github.com:collectionspace/services

CSPACE-7094: Adding script for migrating v4.4 herbarium profile based databases to v4.5.

Merge pull request #207 from ray-lee/anthro

Anthropology profile

CSPACE-6797: Fix claim tests.

CSPACE-7094: Adding script for migrating v4.4 herbarium profile based databases to v4.5.

CSPACE-6793: Configure anthro tenant.

CSPACE-7073: Added code to display bad short IDs in logs.

NOJIRA: Correct some comments.

Merge pull request #206 from ray-lee/4.5-contrib

4.5 service layer fixes

CSPACE-7093: Add filter to set username into a request attribute.

NOJIRA: Change domains in struct date parser refnames to core.collectionspace.org.

NOJIRA: Add claim to services/build.xml.

NOJIRA: Add createsNewFocus as a list result for Batch.

CSPACE-5306: Correct default lifecycle policy for imported records.

Merge branch 'master' of github.com:collectionspace/services

CSPACE-7079: More updates and fixes related to new botgarden and anthro profiles.

NOJIRA: Change mvn.bat to mvn, to match other build.xml files.

CSPACE-7079: Changes for Botantical Garden profile.

NOJIRA: Updating misc Maven plugin versions.

CSPACE-6909: All UCB botgarden service level procedures added and tested.

Merge branch 'botgarden_profile' into botgarden_profile-2

Conflicts:
services/batch/service/src/main/java/org/collectionspace/services/batch/AbstractBatchInvocable.java
services/batch/service/src/main/java/org/collectionspace/services/batch/BatchResource.java
services/batch/service/src/main/java/org/collectionspace/services/batch/nuxeo/BatchDocumentModelHandler.java
services/batch/service/src/main/java/org/collectionspace/services/batch/nuxeo/CreateAndLinkLoanOutBatchJob.java

CSPACE-5985: Making fixes for failed test results.

CSPACE-5985: Making fixes for failed test results.

CSPACE-5985: Making fixes for failed test results.

CSPACE-5985:Adding support for authorization checks for invoking batch jobs.

CSPACE-6909: Adding botanical garden contributions from UCB for official botgarden profile.

CSPACE-7083: Adding tenant bindings for declaring Nuxeo event listeners.

CSPACE-7082: Create a general mechanism for HTTP cache-control settings in the Services.

CSPACE-6711:Added config file to control Nuxeo's disk cache that's used for creating image derivatives.

CSPACE-7081: Code now dynamically querying Nuxeo for picture views -aka, derivative terms/names.

DRYD-84: Adding CacheMaxAge service binding option for including in HTTP response headers.

CSPACE-7060: Add core values part to return payload of PUT/update requests.

CSPACE-7060: Add core values part to return payload of PUT/update requests.

DRYD-92: Fixed RefNameServiceUtils.cloneAuthRefDocItem() method to clone all fields -including refname, workflowstate, and updatedate.

DRYD-90: Fixed problem with /servicegroupd/common/item/${csid} when csid pointed to an authority term

DRYD-90: Fixed problem with /servicegroupd/common/item/${csid} when csid pointed to an authority term

DRYD-90: Fixed problem with /servicegroupd/common/item/${csid} when csid pointed to an authority term

DRYD-106: Added CSID value to items in authority references list.

Merge branch 'DRYD-90'

DRYD-90: Added support for getting a list result and payload result from Service Group resource for a given CSID.

CSPACE-7080: Updated Nuxeo repository config for blobs/binaries.

DRYD-90: Adding support for getting list and full payload for an item given a csid.

Merge remote-tracking branch 'cspace-lyrasis/master' into dts-4.5-merge-1

CSPACE-7069: Added query params to force sycn and normalize term references to use preferred terms.

NOJIRA: Adding code to ignore some cascading events triggered by changes to a caloging record's computed location field.

Merge remote-tracking branch 'cspace-lyrasis/master' into dts-4.5-merge-1

CSPACE-7065: Fixed term display name updates in refojbs after sync.

NOJIRA: Refactored much of the event handler that updates a cataloging record's Computed Current Location field.

CSPACE-7062: Add support for a 'no context' invocation of the UpdateObjectLocation batch job.

NOJIRA: Reverting forced overwrite of initialization-related SQL files during deploy target.  This was removing the drop commands need to reset a deployment.

NOJIRA: Force overwrite of initialization-related SQL files during deploy target

NOJIRA: Adding verbose output to the create_db target.

NOJIRA: Adding debug into to create_cspace_db target.

NOJIRA: Nuxeo 7 upgrade issue.  Adding remote debugging option for the code that generates the service bundles and bindings.

NOJIRA: Nuxeo 7 upgrade issue.  Adding remote debugging option for the code that generates the service bundles and bindings.

CSPACE-7052: Updated nuxeo lib with comments.

CSPACE-7052: Fixed an issue with immutable URI in ServiceGroup resource getItems request.  Added patched jar for Nuxeo bug dealing with simple lists that have an empty first element.

NOJIRA: Renamed Nuxeo 7 3rd party directory to 7.10-HF17.  Added updated postgresql jdbc driver for postgres v9.4

NOJIRA: All service layer tests passing.

CSPACE-7038: Added a UriInfo wrapper class to provide read-write access to query parameters.

CSPACE-7038: Worked through many (if not most) jar conflicts that were preventing successful booting.  Have some tests passing now.  In particular, the Intake service tests are passing.

CSPACE-7037: Upate sources to compile with Nuxeo 7 libraries.  Adding Nuxeo 7 server folder with updated libs and jars.

CSPACE-7032: Maven 3.3.9+ on Windows has is a CMD and not a BAT file. Updated all ant scripts to use just mvn instead of mvn.bat