NOJIRA: More Eclipse settings cleanup.

NOJIRA: Removing unnecessary Eclipse settings files.

CSPACE-6534: Move JUnit version dependency into top-level POM.

Normalizing LF vs CRLF in all files.

Normalizing LF vs CRLF in all files.

CSPACE-6520: Remove 'reporter' stubs for now.

CSPACE-6523: Switch Report service to use read-only Reader datasource rather than read/write Nuxeo datasource.

CSPACE-6520: Move additional database utility code into JDBCTools from ServiceMain.

CSPACE-6520: Uncommented ReportPostInitHandler block in correct (unified config) tenant bindings prototype file. Moved several database-related utility methods out of ServiceMain and ReportPostInitHandler into JDBC Tools. Now initiate, and close, individual DB connections locally within these utility methods, rather than using passed-in connections, with the goal of improving clarity through isolation.

CSPACE-6520: Introduce 'reporter' database role, supplementing and ultimately replacing 'reader' role. Minor refactoring of reports post-init handler.

CSPACE-6504: Replaced non-instance qualified database names in property values.

CSPACE-6511: Updated URL to the latest web-accessible location of a canonical CollectionSpace logo PNG image, in the Acquisition Summary report, so that this sample report can once again be run without error.

CSPACE-6258: Fixed bug that prevented non-preferred terms from being returned in partial term matching queries that used wildcards and/or anchor characters.

NOJIRA: Updated Maven pom files to use version 4.2-SNAPSHOT.

CSPACE-6405: For the v4.x code base, add support for JDBC options. See CSPACE-6404.

CSPACE-6393: The proto-repo-config.xml file now includes a 'binaryStore' element for specifying either a partial or full directory path for Nuxeo binaries. Partial paths are relative to the Nuxeo data directory.

Added a UI error message and a log message when the URL passed in is unreachable for media download.

CSPACE-6322: You must now set either an environment variable name 'recreate_db' to the value true or specify an Ant property named 'recreate_db=true' on the command line when you invoke the 'create_db' target.

Merge remote-tracking branch 'origin/valuationcontrol' into CSPACE-6235-plus-6310

Conflicts:
services/JaxRsServiceProvider/src/main/java/org/collectionspace/services/jaxrs/CollectionSpaceJaxRsApplication.java
services/build.xml
services/common/src/main/cspace/config/services/tenants/tenant-bindings-proto.xml
services/pom.xml

CSPACE-6236: Adding conditioncheck procedure. All unit tests pass

CSPACE-6311: Adding valuationcontrol procedure. All unit tests pass.

Merge pull request #149 from ray-lee/CSPACE-6406

CSPACE-6406: Fix infinite loop in LazyAuthorityRefDocList.java when page...

CSPACE-6406: Fix infinite loop in LazyAuthorityRefDocList.java when page size is 0.

CSPACE-6393: proto-repo-config.xml's <binaryStore> element should be parameterized

Create README.md

Merge pull request #148 from ray-lee/CSPACE-6372

CSPACE-6372: Do a case-sensitive comparison on display names when detecting refname changes.

CSPACE-6372: Change a misnamed variable.

CSPACE-6372: Add comment.

CSPACE-6372: Compare display names case sensitively when checking if refnames have changed.

CSPACE-6359: Misc cleanup of code and comments in RepositoryJavaClientImpl.

CSPACE-6355: Adding missing unix version of mvn validate call -worked only on Windows.

Merge branch 'CSPACE-6168-REM-D' into CSPACE-6168-REM-E

CSPACE-6338: Temporarily commented out a block of the tests of the event listener/handler that maintains the denormalized values for computed current location in Cataloging records. The commented-out blocks pertain to testing CSPACE-6307 changes to switch the secondary ordering of related Movement records to updatedAt timestamps rather than createdAt timestamps; they're being commented out due to intermitent test failures in those blocks. This entire issue needs to be more thoroughly investigated; the failure locus may or may not be in those commented-out tests.

CSPACE-6355: Added warning messages if missing password environment variables or if deprecated ones are still set in the environment.

CSPACE-6345: Improved error message when prototype Nuxeo per-repository config file is missing from its expected location.

Merge remote-tracking branch 'upstream/master' into CSPACE-6168-REM-D

CSPACE-6433: Get database product name, used in a filesystem path to find a database initialization file, via a dynamic means rather than hard-coding this as 'postgresql'.

CSPACE-6349: Additional tweaks to comments in Nuxeo databases initialization script.

CSPACE-6349: Replaced now-obsolete comments in Nuxeo databases initialization script with new comments.

CSPACE-6168: By default, the CollectionSpace instance ID value in build.properties is to be blank, to replicate previous behavior before instance qualification was added. Also added comments to build.properties describing the use of, and convention for, this value.

CSPACE-6329: Remove two, now-obsolete Nuxeo per-repository config files. These files are now generated, in part via the build process and in part during server startup, from a prototype config file.

CSPACE-6349: Fixed yet another glaring typo in method call names.

CSPACE-6346: Removed a hard-coded value that was overriding the instance-qualified 'reader' database role name, by commenting out a configuration block in the prototype tenant bindings file.

CSPACE-6349: Fixed typos in two method call names.

CSPACE-6349: Dynamically manage DROP USER commands in Nuxeo database initialization script during each system startup, rather than relying on build proces to manage these.

CSPACE-6168: Added missing comment in ServiceMain.initialize().

CSPACE-6336: Added all-important semi-colons to end SQL statements in database initialization SQL script.

CSPACE-6336: Avoid inserting progressively more blank lines with each rewrite of the Nuxeo databases initialization SQL script file.

CSPACE-6343: Updated the ReportPostInitHandler to use an instance-qualified database name, rather than assuming that the repository name matches the database name.

CSPACE-6336: DROP DATABASE commands are now written to SQL script that initializes Nuxeo databases.

Merge pull request #144 from ray-lee/CSPACE-6333

CSPACE-6333: Reviewed by Aron and Richard. All looks good.

CSPACE-6336: Fix db product name.

CSPACE-6336: Fix path to db init file.

CSPACE-6336: Fixed typo.

CSPACE-6336: Initial attempt at updating initialization script to drop all Nuxeo-managed databases. As yet untested.

CSPACE-6214: Fixed glaring typo occurring just before server startup.

CSPACE-6329: Rationalize name and value of constant.

CSPACE-6329: Remove portion of behavior description in Javadoc comment, believed now to be incorrect, since we're not allowing null values through to dom4j's Element.addAttribute().

CSPACE-6329: Remove obsolete and potentially confusing comment.

CSPACE-6336: Trivial change to debug statement during work.

CSPACE-6336: Stub code to write DROP DATABASE commands to SQL script: initial, incomplete and as yet untested.

CSPACE-6341: Updated the Report service to use an instance-qualified database name, rather than assuming that the repository name matches the database name.

CSPACE-6340: Updated the ID Service to use an instance-qualified database name, rather than assuming that the repository name matches the database name.

CSPACE-6333: Move repoSession.save call outside the loop, so it doesn't affect the search results each time through the loop.

CSPACE-6168: Need to qualify the database names of the auto-generate Nuxeo repo config files with the CollectionSpace instance ID.  Also, need to change the location of the Nuxeo repo config prototype to /cspace/config/services instead of cspace/services/config.

CSPACE-6333: Add secondary sort on uuid when querying for refobjs and relations containing refnames. Also refactor RelationUtils.findRelationsWithRefName to use RepositoryJavaClientImpl.findDocs.

Merge remote-tracking branch 'aronr/CSPACE-6329-A' into CSPACE-6168-REM-B

CSPACE-6168: Added more support for tenant qualified database names.

CSPACE-6329: Removed now-extraneous copy command left over from merge with CSPACE-6168 branch.

CSPACE-6329: Fixed Ant directive to enable prototype Nuxeo repository config file to replace filter tokens with values during a deploy.

CSPACE-6329: Modify only selected values in each Nuxeo per-repo config file; others will be inserted via an Ant filter during a deploy. (The latter isn't yet working.)

Merge branch 'CSPACE-6329' into CSPACE-6329-A. This merges in Aron's CSPACE-6329 changes into Richard's CSPACE-6168-REM-A branch.

Conflicts:
3rdparty/nuxeo/build.xml
build.properties
services/common/src/main/java/org/collectionspace/services/common/ServiceMain.java

CSPACE-6168: Refactoring hard-coded cspace and nuxeo database names to be configurable.

CSPACE-6329: Copy prototype Nuxeo repo config file to a directory outside the Nuxeo server config directory, so its settings don't get inadvertently picked up by Nuxeo.

CSPACE-6329: Move code to create or update Nuxeo repo config files out of initialize() method into its own method. Clarify text in a number of comments.

CSPACE-6329: Configure an additional attribute. Remove cruft: now-extraneous log statements, commented-out code, etc.

CSPACE-6329: Now writes config files to the Nuxeo server config directory, albeit with mostly placeholder values.

CSPACE-6329: All fields believed to now be edited, with some currently using placeholder content for values.

CSPACE-6329: Added XML element text node editing. Handle null values for attribute and element values.

CSPACE-6329: Fixed path. Added missing Jaxen library dependency.

CSPACE-6329: Preliminary work toward writing per-repo Nuxeo config files. Entirely untested at present.

NOJIRA: Removing misc db.host IP addresses from build.properties file.

NOJIRA: Removing misc db.host IP addresses from build.properties file.

PAHMA-963: Updated merged code from master branch to use new RepositoryInstanceInterface.

Merge branch 'PAHMA-963-REM-A' into PAHMA-963-REM-C

PAHMA-963-REM-A: Added an Spring AOP wrapper for the Nuxeo repository instance class.

Merge pull request #143 from aronr/CSPACE-6134

CSPACE-6134: In the batch job that updates computed current locations in...

CSPACE-6134: In the batch job that updates computed current locations in Cataloging / CollectionObject records, verify that related L/M/I records with null current locations can't 'null out' existing computed current locations. Add verification that candidate current locations can be successfully parsed as refNames.

CSPACE-6129: Added (commented out) entry to the XmlReplay master file, for running tests to verify that the batch job that updates computed current locations in Cataloging / CollectionObject records uses the updatedAt timestamps for related L/M/I records as tiebreakers, when two or more L/M/I records share the same location date.

Merge pull request #142 from aronr/CSPACE-6129

CSPACE-6129: When computing a Cataloging record's current location from ...

CSPACE-6129: When computing a Cataloging record's current location from related L/M/I (Movement) records, if two or more such records have identical location dates, use their update timestamps as a tiebreaker.

PAHMA-963-REM-A: Adding support for misc cases where we and/or Nuxeo were consuming network related errors.  Also discovered that Tomcat does not support resetting the input stream for Servlet requests which means that network related post and update failed requests can't be retried.

CSPACE-6188: Added (commented out) entry for running tests to verify that the batch job that updates computed current locations in Cataloging / CollectionObject records works with versioned records, to the XmlReplay master file.

Merge pull request #140 from aronr/CSPACE-6188

CSPACE-6188: Add test to verify current location batch job works with versioned records.

CSPACE-6188: Added missing auth credentials to XmlReplay-based test.

CSPACE-6188: Provisional XmlReplay-based tests to identify if the update computed current location batch job works as expected in a versioning tenant.

Merge pull request #139 from aronr/CSPACE-6307

CSPACE-6307: Use updatedAt, rather than createdAt, as tiebreaker when id...

CSPACE-6307: Fix trivial typo in comment.

CSPACE-6307: Use updatedAt, rather than createdAt, as tiebreaker when identifying the latest L/M/I record for maintaining the computed current location value in Cataloging records.

Merge pull request #138 from aronr/CSPACE-6308

CSPACE-6308: Don't blank out computed current location value in a Catalo...

CSPACE-6308: Don't blank out computed current location value in a Cataloging record if the most recent movement has a blank current location value.