A message for the commit.

Merge branch 'master' of github.com:collectionspace/services

Conflicts:
README.txt

A change that might have a conflict.

Testing GitHub's ability to edit a file through the web UI.

Not sure why these files are showing as modified.  Must be some whitespace differences?

Another change to my local master.

Making a commit to local master with TortoiseGit client.

NOJIRA: Updating pom files to v2.2-SNAPSHOT.

NOJIRA: Updating the top build.properties file to reflect the 2.2 version of corresponding pom files.

NOJIRA: Updated top level pom version to be 2.2-SNAPSHOT.

CSPACE-4734: 1) Updated trunk pom files to be use version v2.2-SNAPSHOT. 2) Some minor cleanup prior to GIT migration.  3) Also restored previous two commits that were lost when the slice was restored from a backup.

NOJIRA: Reverting last commit of this file.

NOJIRA: In hopes of restoring some lost commits, this commit's sole purpose is to bump the svn rev count.

NOJIRA: In hopes of restoring some lost commits, this commit's sole purpose is to bump the svn rev count.

CSPACE-4684,CSPACE-4728: In script for prepping a working Apache Tomcat folder for distribution of a tarball, added command to copy per-tenant settings.xml files to local-settings.xml, consistent with app layer configuration docs.

CSPACE-4807: Import service code was not properly releasing the Nuxeo repository session.  This was most likely the cause of this problem.

CSPACE-4795: Committing Ray's patches to add the dimensionNote field to the dimension sub-group of the measuredPart group, in the relevant services schema.

CSPACE-1685: Removed thousands AND thousands AND thousands of lines of non-DRY testing code.  Sadly, I could have removed more.  We need to really try hard *not* to write this kind of code.  It's a long-term maint. issue.  We were a bit "penny wise, pound foolish" when we created this code.

CSPACE-1685: Removed thousands AND thousands AND thousands of lines of non-DRY testing code.  Sadly, I could have removed more.  We need to really try hard *not* to write this kind of code.  It's a long-term maint. issue.  We were a bit "penny wise, pound foolish" when we created this code.

CSPACE-4746: Adding Nuxeo 5.5 artifacts for embedded Nuxeo server instance.

NOJIRA: Updating pom.xml versions to 2.1-SNAPSHOT.

CSPACE-4084: Added or corrected configuration entries for object name and object number fields in services' prototype tenant bindings config file.

CSPACE-4773: Enabled remaining authRef and termRef fields in services prototype tenant bindings configuration, including the configuration entries for all remaining deeply nested fields.

CSPACE-4727,CSPACE-4471,CSPACE-4472: Finished reviewing lists of fields in all records that hold authority references (authRefs) and vocabulary term references (termRefs) outside of Cataloging / CollectionObjects (previously checked in via r6251), and updated services prototype tenant bindings accordingly.

CSPACE-4727,CSPACE-4471,CSPACE-4472: Completely reviewed the extensive list of fields in Cataloging / CollectionObject that hold authority references (authRefs) and vocabulary term references (termRefs), and updated services prototype tenant bindings accordingly. Reordered these configuration entries to follow the pattern of the various wiki schema pages for information groups in Cataloging, for ease of future maintenance. Made a minor update to a services authRefs test to reflect these configuration changes.

CSPACE-3931,CSPACE-4490: Cleaned up / removed vestigial top-level otherNumber, otherNumberType fields in services schema for Cataloging / CollectionObject. (These were long ago replaced by a repeatable otherNumberList repeatable group, but were retained until now for backwards compatibility.) Also removed the vestigial remNumber field in that same record type.

CSPACE-4727: Reformatted prototype services tenant bindings file prior to termRefs work. Minor improvements to comments, etc. Added missing service:properties tag in locations_common part.

CSPACE-4572: Services client tests more widely check response status codes prior to getting entity bodies from those responses, thus helping prevent actual error responses from being masked by 'Could not find JaxbContextFinder for media type: text/plain ...' messages. In nearly all such places prior to calling getEntity(), also replaced more verbose checking of status codes with calls to assertStatusCode() method in a base client test class.

CSPACE-4748, CSPACE-4750: Added a new class to the http client hierarchy to consolidate/share existing code that deals with loading/creating xml payloads for the tests.

CSPACE-4748, CSPACE-4750: Fixed issue with image metadata not being correctly extracted.  Also fixed problem with temporary image files showing up in the wrong locations.  Included some minor cleanup of a few of the base client test classes.

CSPACE-4684,CSPACE-4728: Added fixme comment to the nightly / tarball distribution utility script.

CSPACE-4684,CSPACE-4728: Adding services scripts directory for maintaining utility scripts used in continuous integration, distribution prep, and other such purposes under version control. Adding initial script used for prepping a copy of a working Apache Tomcat folder, under CollectionSpace 2.0, for distribution as a tarball. This prep include omitting copying of folders containing temporary items (e.g. logs, temp) and eliding passwords.

CSPACE-4740: RefNameServiceUtils method that updates refnames (updateAuthorityRefDocs) now throws exceptions if underlying DB calls fail.

CSPACE-4745: DocumentNotFoundException stack traces should only appear in the logs when logging level is set to TRACE

CSPACE-4735: Nuxeo database "templates" now deprecated since we're using an embedded Nuxeo model. The DM's nuxeoctl tool used to proces this for us and is no longer applicable.

CSPACE-4737: Remove obsolete "Hello, world!" directory from services trunk.

CSPACE-4736: Removing unnecessary and obsolete artifacts from trunk.

CSPACE-4735: Nuxeo database "templates" now deprecated since we're using an embedded Nuxeo model. The DM's nuxeoctl tool used to proces this for us and is no longer applicable.

CSPACE-4639: Until issue http://issues.collectionspace.org/browse/CSPACE-4639 is resolved, we need to use this patched Nuxeo artifact that is only available on our public Maven repository -see http://source.collectionspace.org:8081/artifactory Once the issue is resolved and a public version of the artifact becomes available, we should revert this dependency's version to be the following: <version>${nuxeo.core.version}</version>

CSPACE-4729: Adjusting tests to see if workflow state changes are happening asynchronously.

CSPACE-4729: Adjusting tests to see if workflow state changes are happening asynchronously.

CSPACE-4632: Checking in config changes from Patrick to services tenant bindings that specify object name and number properties for Organization and Taxon records.  These properties were already present for Person and Storage Location, but had been missing from the former two authorities.

CSPACE-4687: Authority term references in the Measured By field, within the nested Measured Part / Dimensions structure in Cataloging / CollectionObject and Media records, are now returned by services calls to return authorityrefs.  These terms aren't (yet) showing up in the termsused array sent from app to UI; this might require additional investigation.

CSPACE-4639: Until issue http://issues.collectionspace.org/browse/CSPACE-4639 is resolved, we need to use this patched Nuxeo artifact that is only available on our public Maven repository -see http://source.collectionspace.org:8081/artifactory Once the issue is resolved and a public version of the artifact becomes available, we should revert this dependency's version to be the following: <version>${nuxeo.core.version}</version>

CSPACE-4704 - Added hack to work around Nuxeo regression tokenizing on periods.

CSPACE-4629 displayName change propagation was not working for termList items. Also, at least one case (loanout status), the term was not configured. There are probably more cases of missing termRef configuration. Filing that as a separate bug.

CSPACE-2323, CSPACE-3016, etc., Fixes to properly integrate with new Nuxeo libs, making code clean w.r.t. sessions, fixes to hierarchy handling in authorities.
Changed logging configuration to rotate among 10 files of 5MB each, so we have more context on the server. Also removed the stdout copy that was bloating catalina.out (on 1.13 QA, the file is over 1.1GB).
Added new tests to exercise refObjs and authRefs more carefully.
Tweaked XMLReplay to output clock times for each test, making it easier to align tests with log output.
Added some debug support for startup issues with Nuxeo and Workspaces.
Removed pointless output from LoanoutValidatorHandler.

CSPACE-4639: Updated Nuxeo libs/jars/bundles to the official 5.5-RC1 release.  Removing all libs that are not required for our webapp.

CSPACE-4639: Updated Nuxeo libs/jars/bundles to the official 5.5-RC1 release.  Removing all libs that are not required for our webapp.

CSPACE-4639: Updated Nuxeo libs/jars/bundles to the official 5.5-RC1 release.  Removing all libs that are not required for our webapp.

CSPACE-4639: Updated Nuxeo libs/jars/bundles to the official 5.5-RC1 release.  Removing all libs that are not required for our webapp.

CSPACE-4639: Updated Nuxeo libs/jars/bundles to the official 5.5-RC1 release.

CSPACE-4639: Updated Nuxeo libs/jars/bundles to the official 5.5-RC1 release.

CSPACE-4639: Adding the latest version of Nuxeo jars/bundles.

CSPACE-4639: Added more support for better session and transaction management with Nuxeo EP.

CSPACE-3017 Made keyword search quietly absorb * chars.

CSPACE-4302 Add support for booleans (AND, OR, NOT) and phrase search (latter waiting for update from nuxeo).

CSPACE-3937: Applying Rick's patches to convert Ownership Date in Cataloging / CollectionObject and Date in Media to structured date types, in services schema.

CSPACE-4601 fix regex in sortBy to allow sortBy on complex fields.

CSPACE-3537 - Fixed test for complex authefs fields in Loansin.

CSPACE-4486,CSPACE-4589: Made Inscription Content (aka Textual Inscription) and Inscription Description (aka Non-Textual Inscription) fields into two repeatable groups in the Services layer; updated tests.

CSPACE-3537 - Fixed configuration of complex authefs fields in Loansin.

CSPACE-4526: Adding missing Nuxeo jars for proper image processing.

CSPACE-4526: Changing build.properties back to a PostgreSQL default.

CSPACE-4526: Merge of Tomcat/Nuxeo 5.5 upgrade work with trunk.

CSPACE-1927 Added missing test resources

CSPACE-4526: Updated JaxRsServiceProvider build.xml's deploy and undeploy targets to delete Tomcat's copy of our context.xml file at  $CATALINA_BASE/conf/[enginename]/[hostname]/cspace-services.xml.  We expected Tomcat would replace this file when a new .war was deployed, but it is not.  Since the settings in the this file override the ones inside the .war (and exploded war) and could be stale, we need to delete it.

CSPACE-2818, CSPACE-3537 Refactored logic that handles authorityRefs, refObjs, and displayName update, so that it can handle authRefs in deeply nested structures. Still awaiting latest code from Nuxeo to integrate their updated search, but this change at least fixes 2818, and makes us ready for the fix for 3537 and 2323. Also cleaned up handling of authorityRefs for garbage values - now produces a log error and does not produce an authorityRef item (was producing an empty one). Also added a partial fix and notes to remove the hard-coded resource paths for authority types.

CSPACE-4526: Updated JaxRsServiceProvider build.xml's deploy and undeploy targets to delete Tomcat's copy of our context.xml file at  $CATALINA_BASE/conf/[enginename]/[hostname]/cspace-services.xml.  We expected Tomcat would replace this file when a new .war was deployed, but it is not.  Since the settings in the this file override the ones inside the .war (and exploded war) and could be stale, we need to delete it.

CSPACE-4526: Adding servlet-api dependency to imports/service pom.  For some reason, Maven 2.2.1 was finding this javax artifact somewhere in the dependency tree, but Maven 3 was not.  Seems like Maven 3 is being more rational.

CSPACE-4526,CSPACE-1927: Temporarily commented out several XmlReplay-based tests of updating display names in authrefs, when a display name is updated in an authority, necessitated by Tomcat 6 / Nuxeo 5.4.x changes.

CSPACE-4526: Avoid filtering outside config directory in nuxeo-server.

CSPACE-4526: Parameterized default-repo-config.xml in nuxeo-server.

CSPACE-4526: Corrected xaDataSource in datasources-config.xml

CSPACE-4526: Removing now-unused nuxeo.conf file. Parameterizing Nuxeo datasources-config.xml file in nuxeo-server directory.

CSPACE-4526: Updated to Nuxeo 5.5 jars!!!  These are not the latest but are official 5.5 jars as of November 4, 2011.

CSPACE-2818, CSPACE-3537 Refactored logic that handles authorityRefs, refObjs, and displayName update, so that it can handle authRefs in deeply nested structures. Still awaiting latest code from Nuxeo to integrate their updated search, but this change at least fixes 2818, and makes us ready for the fix for 3537 and 2323. Also cleaned up handling of authorityRefs for garbage values - now produces a log error and does not produce an authorityRef item (was producing an empty one). Also added a partial fix and notes to remove the hard-coded resource paths for authority types.

CSPACE-4256: Merged services trunk changes from r5918 through r6056 into the Apache 6 / Nuxeo 5.4.2 services branch. All tests ran successfully, except for two individual test cases in an authRefs-related XmlReplay test group, which have been commented out for now: afterUpdateGetLoan5 and afterUpdateGetLoan9. (Both appear to test if changes to a display name in a Person record are propagated to the display name in authRef-containing field(s) in Loan In.)

CSPACE-4526: Uncommented references to blob and media modules in module list in services POM.

CSPACE-4526: With Richard, parameterized additional data source configuration files via POM replacement. Some of these changes will be moot once integrated with forthcoming Nuxeo fix for JNDI corruption issue.

CSPACE-4526: Adding support for a new set of Nuxeo jars dated 11/4/2011.

CSPACE-4526: Added Nuxeo support libs and settings for our Media and Blob services.  All media and blob service tests are now passing.

CSPACE-4526: Adding more support for PostgreSQL to be the default DB.  These changes will be reverted once the Nuxeo JNDI fix is in place.

CSPACE-4526: Adding more support for PostgreSQL to be the default DB.  These changes will be reverted once the Nuxeo JNDI fix is in place.

CSPACE-4526: Adding more support for PostgreSQL to be the default DB.  These changes will be reverted once the Nuxeo JNDI fix is in place.

CSPACE-3937,CSPACE-4490: In services Cataloging / CollectionObject schema, converted contentDate to a structured date; was formerly a scalar date field. Made the existing objectProductionDateGroup structured date field repeatable, renaming the parent element to objectProductionDateGroupList. Removed a legacy top-level set of scalar fields, believed to be unused, that appear to constitute an early prototype or placeholder for structured date.

CSPACE-4526: Change default servies configuration in Apache Tomcat 6/Nuxeo 5.4.x branch to use PostgreSQL, rather than MySQL, per Patrick.

CSPACE-4526: Adding a default log4j.properties file for our webapp .war file.

CSPACE-4526: Committing Richard's change to the PostgreSQL authorization .sql file, to correct a column name in permissions_actions.

CSPACE-4526: Added Nuxeo support libs and settings for our Media and Blob services.  All media and blob service tests are now passing.

CSPACE-3943,CSPACE-3937: Added earliest and latest scalar date value fields, and scalar value computed flag, to objectProductionDate in services Cataloging / CollectionObject schemas.  These fields will also appear in all other instances of structured dates created via CSPACE-3937.

CSPACE-4526: Temporarily disabled blob and media services.

CSPACE-4526: Adding missing classes to the repo.

CSPACE-4526: Updated all Ant scripts and properties to reflect changes for an Apache Tomcat and embedded Nuxeo deployment environment.

CSPACE-4084 Added updatedAt to each item in refObjs results.

CSPACE-4041 Cleaned up duplicate fields in relations. Cleaned up the associated test files.

CSPACE-4526: Adding a directory for the JDBC drivers.

CSPACE-4526: Adding a directory for the JDBC drivers.

CSPACE-4469: The value of the uri element in the collectionspace_core part for Contact records now reflects the contextual path through which the Contact was created, with the 'owning' authority and item.

CSPACE-4582: When retriving lists of taxon terms, the uri fields in list items now correctly reflect the name of the parent authority ('taxonomyauthority').